Вторжение злых чужаков на Землю начинается. Полицейские офицеры превращаются в скверных «копов-свиней», похищающих женщин и пытающихся их оплодотворить инопланетным эмбрионом; такая ситуация вызывает массовые смерти и уничтожения на многих территориях. Играя за Дюка Нюкема, пользователь применяет различное уникальное оружие, включая Опустошитель, Уменьшитель и Замораживатель. Игровой рынок, после прорыва Doom, на то время был наполнен подобными шутерами от первого лица. Тем не менее, Duke Nukem 3D стал уникальной смесью месторасположения, подхода и чувства юмора, перейдя в разряд хитов.
